MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 12293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016624	ACC	2	6	38343	38348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294105
1002	NC_016624	AGCC	2	8	38355	38362	25 %	0 %	25 %	50 %	374294105
1003	NC_016624	GTC	2	6	38390	38395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294105
1004	NC_016624	CGG	2	6	38401	38406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294105
1005	NC_016624	CAG	2	6	38447	38452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294105
1006	NC_016624	GCC	2	6	38495	38500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294105
1007	NC_016624	CCGA	2	8	38529	38536	25 %	0 %	25 %	50 %	374294105
1008	NC_016624	CGG	2	6	38575	38580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294105
1009	NC_016624	CCG	2	6	38629	38634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294105
1010	NC_016624	TTTC	2	8	38801	38808	0 %	75 %	0 %	25 %	374294106
1011	NC_016624	GC	3	6	38898	38903	0 %	0 %	50 %	50 %	374294106
1012	NC_016624	CCGG	2	8	38939	38946	0 %	0 %	50 %	50 %	374294106
1013	NC_016624	CCGC	2	8	38953	38960	0 %	0 %	25 %	75 %	374294106
1014	NC_016624	CCG	2	6	38995	39000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294106
1015	NC_016624	GGCC	2	8	39020	39027	0 %	0 %	50 %	50 %	374294106
1016	NC_016624	ACG	2	6	39036	39041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294106
1017	NC_016624	GAT	2	6	39074	39079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294106
1018	NC_016624	ACC	2	6	39114	39119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294106
1019	NC_016624	TGC	2	6	39145	39150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294106
1020	NC_016624	ATG	2	6	39197	39202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294107
1021	NC_016624	CGCCGG	2	12	39232	39243	0 %	0 %	50 %	50 %	374294107
1022	NC_016624	GTG	2	6	39272	39277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294107
1023	NC_016624	CACCGC	2	12	39304	39315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294107
1024	NC_016624	GCG	2	6	39321	39326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294107
1025	NC_016624	CCG	2	6	39334	39339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294107
1026	NC_016624	CGG	2	6	39456	39461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294107
1027	NC_016624	CGA	2	6	39463	39468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294107
1028	NC_016624	GAT	2	6	39511	39516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294107
1029	NC_016624	CG	4	8	39573	39580	0 %	0 %	50 %	50 %	374294107
1030	NC_016624	ATG	2	6	39581	39586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294107
1031	NC_016624	CGT	2	6	39592	39597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294107
1032	NC_016624	CTG	2	6	39602	39607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294107
1033	NC_016624	CGC	3	9	39654	39662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294108
1034	NC_016624	CGC	2	6	39666	39671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294108
1035	NC_016624	TCG	2	6	39686	39691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294108
1036	NC_016624	CGC	2	6	39722	39727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294108
1037	NC_016624	CCG	2	6	39734	39739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294108
1038	NC_016624	GGC	2	6	39756	39761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294108
1039	NC_016624	CGG	2	6	39780	39785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294108
1040	NC_016624	AGCG	2	8	39832	39839	25 %	0 %	50 %	25 %	374294108
1041	NC_016624	GC	3	6	39872	39877	0 %	0 %	50 %	50 %	374294108
1042	NC_016624	CGT	2	6	39882	39887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294108
1043	NC_016624	GGC	2	6	39900	39905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294108
1044	NC_016624	CGT	2	6	39924	39929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294108
1045	NC_016624	TGC	2	6	40182	40187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1046	NC_016624	GAC	2	6	40201	40206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1047	NC_016624	CTG	2	6	40208	40213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1048	NC_016624	CGC	2	6	40216	40221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294109
1049	NC_016624	CGC	2	6	40224	40229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294109
1050	NC_016624	TCG	2	6	40233	40238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1051	NC_016624	GGT	3	9	40240	40248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294109
1052	NC_016624	TCG	2	6	40320	40325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1053	NC_016624	TGG	2	6	40332	40337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294109
1054	NC_016624	GC	3	6	40368	40373	0 %	0 %	50 %	50 %	374294109
1055	NC_016624	TCG	2	6	40407	40412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294109
1056	NC_016624	GCG	2	6	40449	40454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294110
1057	NC_016624	CCGG	2	8	40501	40508	0 %	0 %	50 %	50 %	374294110
1058	NC_016624	GCG	3	9	40513	40521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294110
1059	NC_016624	GCCA	2	8	40524	40531	25 %	0 %	25 %	50 %	374294110
1060	NC_016624	CGC	2	6	40569	40574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294110
1061	NC_016624	C	6	6	40590	40595	0 %	0 %	0 %	100 %	374294110
1062	NC_016624	GCC	2	6	40614	40619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294110
1063	NC_016624	CGC	2	6	40635	40640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294110
1064	NC_016624	GGC	2	6	40659	40664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294110
1065	NC_016624	CGA	2	6	40671	40676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294110
1066	NC_016624	CTG	3	9	40681	40689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294110
1067	NC_016624	CCGG	2	8	40709	40716	0 %	0 %	50 %	50 %	374294110
1068	NC_016624	CGGA	2	8	40717	40724	25 %	0 %	50 %	25 %	374294110
1069	NC_016624	CG	3	6	40790	40795	0 %	0 %	50 %	50 %	374294110
1070	NC_016624	GC	3	6	40828	40833	0 %	0 %	50 %	50 %	374294110
1071	NC_016624	CTGC	2	8	40857	40864	0 %	25 %	25 %	50 %	374294110
1072	NC_016624	TCCT	2	8	40948	40955	0 %	50 %	0 %	50 %	374294110
1073	NC_016624	GTC	2	6	40956	40961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294110
1074	NC_016624	GCG	2	6	40965	40970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294110
1075	NC_016624	GGC	2	6	41103	41108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294110
1076	NC_016624	CGGC	2	8	41151	41158	0 %	0 %	50 %	50 %	374294110
1077	NC_016624	CGGCC	2	10	41187	41196	0 %	0 %	40 %	60 %	374294110
1078	NC_016624	TGC	2	6	41204	41209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294110
1079	NC_016624	GAC	2	6	41219	41224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294110
1080	NC_016624	GGTG	2	8	41726	41733	0 %	25 %	75 %	0 %	374294111
1081	NC_016624	A	7	7	41808	41814	100 %	0 %	0 %	0 %	374294111
1082	NC_016624	CAG	2	6	41855	41860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294111
1083	NC_016624	CGC	2	6	41929	41934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294111
1084	NC_016624	AGA	2	6	41943	41948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294111
1085	NC_016624	AGCC	2	8	41974	41981	25 %	0 %	25 %	50 %	374294111
1086	NC_016624	ATG	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294111
1087	NC_016624	GCG	2	6	42009	42014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294111
1088	NC_016624	TGG	2	6	42215	42220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294111
1089	NC_016624	CTC	2	6	42273	42278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294111
1090	NC_016624	TGA	2	6	42283	42288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294111
1091	NC_016624	T	6	6	42307	42312	0 %	100 %	0 %	0 %	374294111
1092	NC_016624	AGTG	2	8	42371	42378	25 %	25 %	50 %	0 %	374294111
1093	NC_016624	C	6	6	43843	43848	0 %	0 %	0 %	100 %	374294112
1094	NC_016624	T	6	6	43882	43887	0 %	100 %	0 %	0 %	374294112
1095	NC_016624	TGG	2	6	43906	43911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294112
1096	NC_016624	CAT	2	6	43935	43940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294112
1097	NC_016624	GCG	2	6	44007	44012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294112
1098	NC_016624	GCG	2	6	44016	44021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294112
1099	NC_016624	TTC	2	6	44029	44034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294112
1100	NC_016624	CGA	2	6	44102	44107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294112
1101	NC_016624	C	6	6	44130	44135	0 %	0 %	0 %	100 %	374294112
1102	NC_016624	TCG	2	6	44185	44190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294112
1103	NC_016624	CCG	2	6	44321	44326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294113
1104	NC_016624	ATG	2	6	44332	44337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294113
1105	NC_016624	CGG	2	6	44351	44356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294113
1106	NC_016624	CGCC	2	8	44357	44364	0 %	0 %	25 %	75 %	374294113
1107	NC_016624	TCT	2	6	44376	44381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294113
1108	NC_016624	AGC	2	6	44431	44436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294113
1109	NC_016624	TTG	2	6	44449	44454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294113
1110	NC_016624	CTG	2	6	44775	44780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294114
1111	NC_016624	GTGCTG	2	12	44856	44867	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294114
1112	NC_016624	TCC	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294114
1113	NC_016624	CTG	2	6	44922	44927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294114
1114	NC_016624	GTG	2	6	44928	44933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294114
1115	NC_016624	TGC	2	6	44938	44943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294114
1116	NC_016624	CGC	3	9	45002	45010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294114
1117	NC_016624	GGC	2	6	45048	45053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294114
1118	NC_016624	GTG	2	6	45069	45074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294114
1119	NC_016624	TCT	2	6	45076	45081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294114
1120	NC_016624	GTC	2	6	45090	45095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294114
1121	NC_016624	TCA	2	6	45109	45114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294114
1122	NC_016624	TC	3	6	45200	45205	0 %	50 %	0 %	50 %	374294114
1123	NC_016624	CGA	2	6	45218	45223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294114
1124	NC_016624	GC	3	6	45231	45236	0 %	0 %	50 %	50 %	374294114
1125	NC_016624	CGC	4	12	45234	45245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294114
1126	NC_016624	GGA	2	6	45254	45259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294114
1127	NC_016624	GCG	2	6	45307	45312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294114
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1129	NC_016624	TCA	2	6	45340	45345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294114
1130	NC_016624	GGC	2	6	45354	45359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294114
1131	NC_016624	CGC	2	6	45401	45406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294114
1132	NC_016624	ACC	2	6	45417	45422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294114
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1149	NC_016624	CTT	2	6	45923	45928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294114
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1154	NC_016624	CG	3	6	46054	46059	0 %	0 %	50 %	50 %	374294114
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1250	NC_016624	CCCGCG	2	12	49053	49064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294117
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1373	NC_016624	GCC	2	6	53797	53802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294121
1374	NC_016624	TCC	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294121
1375	NC_016624	ACAG	2	8	53886	53893	50 %	0 %	25 %	25 %	374294121
1376	NC_016624	CCG	2	6	54048	54053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294121
1377	NC_016624	CAG	2	6	54073	54078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294121
1378	NC_016624	GCTCC	2	10	54115	54124	0 %	20 %	20 %	60 %	374294121
1379	NC_016624	TCC	2	6	54143	54148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294121
1380	NC_016624	GCC	2	6	54149	54154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294121
1381	NC_016624	GCGG	2	8	54163	54170	0 %	0 %	75 %	25 %	374294121
1382	NC_016624	CACC	2	8	54171	54178	25 %	0 %	0 %	75 %	374294121
1383	NC_016624	GC	3	6	54212	54217	0 %	0 %	50 %	50 %	374294121
1384	NC_016624	CCG	2	6	54300	54305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294121
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1387	NC_016624	TCAACG	2	12	54626	54637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294123
1388	NC_016624	CCT	2	6	54675	54680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294123
1389	NC_016624	GCG	2	6	54728	54733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294123
1390	NC_016624	GCG	2	6	54743	54748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294123
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1404	NC_016624	GTC	2	6	55207	55212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294124
1405	NC_016624	GC	3	6	55214	55219	0 %	0 %	50 %	50 %	374294124
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1490	NC_016624	CTGGCA	2	12	58413	58424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294126
1491	NC_016624	A	6	6	58452	58457	100 %	0 %	0 %	0 %	374294126
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1493	NC_016624	GGCG	2	8	58673	58680	0 %	0 %	75 %	25 %	374294127
1494	NC_016624	CAC	3	9	58698	58706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294127
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1496	NC_016624	CGA	2	6	58826	58831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294127
1497	NC_016624	GC	3	6	58833	58838	0 %	0 %	50 %	50 %	374294127
1498	NC_016624	CGC	2	6	58853	58858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294127
1499	NC_016624	CCGC	2	8	58865	58872	0 %	0 %	25 %	75 %	374294127
1500	NC_016624	CGG	2	6	58880	58885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294127

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